Organizację Powiatowej Stacji Sanitarno-Epidemiologicznej w Słupcy, w tym zakres działania poszczególnych komórek organizacyjnych, określa Regulamin Organizacyjny Powiatowej Stacji Sanitarno-Epidemiologicznej w Słupcy.

W skład Powiatowej Stacji wchodzą następujące komórki organizacyjne, które przy znakowaniu spraw i pism używaja następujących symboli:

1) Oddział Ekonomiczny i Administracyjny (EA), w skład którego wchodzą:
a) Stanowisko Pracy do Spraw Ekonomiczno – Księgowych,(EA.EK)
b) Stanowisko Pracy do Spraw Administracyjno – Technicznych;(EA.AT)
2) Oddział Nadzoru (ON), w skład którego wchodzą:
   a) Stanowisko Pracy do Spraw Epidemiologii, (ON.EP)
   b) Stanowisko Pracy do Spraw Higieny Żywności i Żywienia, (ON.HŻ)
   c) Stanowisko Pracy do Spraw Zapobiegawczego Nadzoru Sanitarnego, (ON.NS)
   d) Stanowisko Pracy do Spraw Higieny Dzieci i Młodzieży, (ON.HD)
   e) Stanowisko Pracy do Spraw Higieny Komunalnej, (ON.HK)
    f) Stanowisko Pracy do Spraw Higieny Pracy; (ON.HP)
3) Stanowisko Pracy do Spraw Bezpieczeństwa i Higieny Pracy i Ochrony         Przeciwpożarowej;(BHP)
4) Stanowisko Pracy do Spraw Kadr i Szkoleń; (KS)
5) Stanowisko Pracy do Spraw Obrony Cywilnej i Spraw Obronnych; (OC)
6) Stanowisko Pracy do Spraw Organizacji i Statystyki; (SO)
7) Stanowisko Pracy do Spraw Oświaty Zdrowotnej i Promocji Zdrowia; (OZ)
8) Stanowisko Pracy Głównego Księgowego; (EA)
9) Stanowisko Pracy Głównego Specjalisty do Spraw Systemu Jakości;(SJ)
10) Stanowisko Pracy Radcy Prawnego;(RP)
11) Stanowisko Pracy Pełnomocnika do Spraw Ochrony Informacji Niejawnych;(PIN)
12) Stanowisko Pracy Inspektora Ochrony Danych;(IOD)